助理工程师证可以通过官方网站、电话以及人社局窗口三种方式进行查询。

官方网站查询：目前，部分地区已经开通了助理工程师证书的网上查询服务。用户可以通过访问全国人力资源和社会保障政务服务平台或当地人社局指定的官方网站，输入证书编号或个人信息进行查询。这种方式方便快捷，但需要注意的是，由于证书信息录入系统需要一定时间，新颁发的证书可能暂时无法立即查询到。

电话查询：另一种常用的查询方式是电话查询。用户可以在人社局官方网站上找到联系电话，并按照提示进行证书真伪的咨询。在拨打电话时，请务必核实电话号码的真实性，以免被误导。电话查询虽然相对直接，但可能无法获取详细的证书信息。

人社局窗口查询：对于希望获取最准确、最直观证书信息的用户，可以选择前往当地人社局窗口进行查询。在查询时，用户需要携带相关证件和证书原件或复印件，以便工作人员进行核实。虽然这种方式可能耗时较长，但能够确保查询结果的准确性和权威性。

此外，还有一些非官方的查询方式，如通过微信公众号等第三方平台进行查询。然而，这些方式可能存在信息滞后或不准确的风险，因此建议用户优先选择上述官方查询方式。同时，对于任何要求提供个人信息或支付费用的查询服务，用户应保持警惕，以免遭受诈骗。