大一学生暑假前往日本旅游，办理护照和签证的流程和注意事项如下：

护照办理应在户籍所在地进行，通常最快需要一周时间，最长可能需要15天。因此，应尽早开始准备。

签证申请应在出发前约一个月左右完成。如果通过旅行社安排，护照办理好后只需将其提供给旅行社即可。日元准备方面，需考虑到导游小费、自费项目等开销，具体金额依据参加的线路收费说明而定。其他消费则建议携带Visa卡以方便支付。

总结而言，确保护照办理及时，合理规划日元及其他费用的准备，即可顺利进行日本之行。