一、拟南芥转录因子文库筛选理论基础

微如草芥，却贡献巨大的模式植物——拟南芥拥有有5对染色体，1.25亿个碱基对，编码着2.5万个基因，据拟南芥转录因子数据库（DATF）统计，可查询2290个转录因子。

我们通过构建酵母文库单杂筛选或者DNA pulldown来筛选转录因子时，会发现捕获的转录因子数量特别少，甚至没有转录因子，这2000多个转录因子到哪里去了？

转录因子是一类周期性调控蛋白，只有在特定的生长时期，特定的组织部位才会有一定丰度的表达。其功能如同手枪的“扳机”，电路的“开关”。微量表达就能调控下游靶基因，改变生物性状。功能如此强大的转录因子，如神龙见首不见尾的大侠，只有在“需要”的时候，偶露峥嵘。

构建酵母单杂文库时，即使选择建库材料时遵循了跨时空的原则，能够囊括的转录因子基因依然很少，筛不到靶标转录因子实属正常。

北京大学邓兴旺院士团队针对这种状况，将拟南芥中出现频率较高的1500多种转录因子调取出来，组成转录因子文库，避开了时空效应，这是最“土”的手段，却是科研路上最“聪明”的策略。

转录因子文库的实验设计和实验方法见刊于《Molecular Plant》题为“A high-throughput screening system for Arabidopsis Transcription factors and its application to Med25-dependent tranional regulation