综合教务管理系统通常包含以下主要功能模块：

学生管理：包括学生信息的录入、修改和查询，学生档案管理，学籍管理，学生注册和退学管理等。

教师管理：包括教师信息的录入、修改和查询，教师档案管理，教师排课和教学分配，教师考勤管理等。

课程管理：包括课程信息的录入、修改和查询，课程计划和安排，课程资源管理，课程评估和评分等。

成绩管理：包括学生成绩的录入、修改和查询，成绩统计和分析，成绩报告和通知，学分管理等。

考勤管理：包括学生和教师的考勤记录，考勤统计和报告，考勤异常处理，请假管理等。

课程安排：包括课程时间表的制定和管理，课程调度和冲突处理，教室和设备的分配和管理等。

学生选课和课程注册：包括学生选课和退课的管理，课程容量和限制管理，学生课程注册确认等。

学费管理：包括学费缴纳和收据管理，学费余额和欠款查询，学费退款和退费管理等。

学生档案管理：包括学生档案的归档和管理，学生个人信息和历史记录的维护，学生证明和报告的生成等。

教务报表和统计：包括生成各类教务报表和统计数据，如学生人数统计、课程评估结果、学生成绩分布等。

信息共享和沟通：包括学生、教师和家长之间的信息共享和沟通平台，如公告发布、课程材料共享、在线讨论等。

系统设置和管理：包括教务管理系统的设置和配置，用户权限管理，系统备份和恢复，日志记录和审计等。

综合教务管理系统旨在协助教育机构管理学生、教师和课程等各个方面的教务工作，提高工作效率和管理水平。具体的功能模块和特点可能会因不同的教务管理系统供应商而有所差异，因此在选择系统时，可以根据自己机构的需求进行评估和比较。