在海口，共有八所高等院校，其中公办本科院校三所，分别为海南大学、海南师范大学和海南医学院。

海南大学拥有三个校区，分别位于海口市海甸、儋州市（原华南热带农业大学）和海口市城西（原华南热带农业大学海口校区），是国家211学院。

海南师范大学有两个校区，分别位于海口市龙昆南路南校区和桂林洋大学城校区，是一所省属重点大学。

海南医学院有两个校区，分别位于海口市龙华和城西，是一所本科带专科院校。

民办性质本科院校海口经济学院有两个校区，分别位于海口市和大学城校区（计划2010年全部迁往大学城校区），也是一所本科带专科院校。

海口还有五所公办专科院校，分别是海南职业技术学院、海南经贸职业技术学院、海南政法职业学院、海南琼台师范高等专科学校（两个校区，分别位于海口市大学城和府城）。

此外，还有两所民办性质专科院校，分别是海南科技职业学院和海南万和信息职业技术学院。海南科技职业学院有一个校区，位于原中央美院海南分院旧址，后由南昌航天科技集团创办。海南万和信息职业技术学院也有一所校区，位于海南省海口市秀英区兴海路，由广东省万和电器集团等知名企业投资建设。