医学系和医学院在名称上虽然相近，但实际上存在一定的区别。医学系是学校内设置的一个学科，专门负责教授医学知识，培养学生的医学理论基础。而医学院则是指学生就读医学专业的教育机构，是专门从事医学教育的场所。

具体来说，医学系是学校的一个学院或者系别，隶属于整个大学，负责提供医学相关的课程和教学。医学院则是独立的教育机构，通常设立在大学内部，专注于医学教育和研究。医学院的学生在完成学业后，可以获得医学学位。

简单来说，医学系是学校内的一部分，而医学院是学校内专门从事医学教育的机构。医学系更加注重理论知识的传授，而医学院则更侧重于实践技能的培养。两者都是医学教育不可或缺的组成部分，但侧重点有所不同。

在教学资源方面，医学系可能与其他学科共享资源，而医学院则拥有专门的实验室、图书馆等设施，为学生提供更好的学习条件。同时，医学院还可能与医院合作，为学生提供实习和临床实践的机会。

综上所述，虽然医学系和医学院都与医学教育密切相关，但在组织结构、侧重点以及教学资源分配上，两者还是存在一定的差异。了解这些差异有助于我们更好地理解医学教育的体系和特点。