这还用问吗，当然是第三军医大学好了。第三军医大学的传染病内科，呼吸内科，心血管内科都是国家重点学科，整个外科学所有下属学科也都是国家重点学科。消化内科和眼科学是国家重点（培育）学科。而重庆医科大学只有儿科、神经内科、传染病内科是国家重点学科。