工程师与注册公用设备工程师在职责和任职条件方面存在显著差异。首先，从主体上看，工程师是一个更广泛的概念，他们具备从事工程系统操作、设计、管理、评估的能力，而注册公用设备工程师则是通过了特定资格考试的专业人员。

在职责方面，工程师通常负责制定项目的总体实施计划，包括年度和分月度的实施计划，并对项目实施过程中的计划进行统计分析和调整，确保项目顺利进行。相比之下，注册公用设备工程师则更专注于公用设备工程的项目管理，包括设备招标、采购咨询及对本专业设计项目的施工进行指导和监督。

此外，从任职条件来看，工程师需要具备丰富的工程技术研究和设计经验，并能在提高研究、设计水平和经济效益方面取得一定成就。而注册公用设备工程师则承担着更大的责任，因公用设备专业工程设计质量问题导致的经济损失，注册公用设备工程师需要承担赔偿责任，并根据合同向签章的注册公用设备工程师追偿。

因此，虽然两者都属于工程技术领域，但注册公用设备工程师在特定的专业领域内具有更深入的知识和更严格的责任要求。