气孔运动的最终原因是保卫细胞的吸水膨胀或失水皱缩。对气孔运动机理目前有三种学说：

　　1、淀粉—糖变化说在光照的前提下，保卫细胞进行光合作用，CO2浓度降低，使之pH值增高至6.1～7.3，这时，淀粉磷酸化酶水解淀粉为葡萄糖，导致保卫细胞水势下降，引起吸水膨胀和气孔开放。在黑暗中，呼吸产生CO2，pH下降，葡萄糖+磷酸合成淀粉，水势上升，细胞失水，气孔关闭。

　　2、无机离子说光下，光活化H+泵ATP酶分解ATP，在H+分泌到细胞壁外的同时，钾离子进入保卫细胞，导致水势下降，保卫细胞吸水膨胀，气孔开放。

　　3、苹果酸生成说光下，CO2被消耗，pH上升，淀粉经糖酵解产 为苹果酸，细胞水势下降，水分进入保卫细胞，细胞膨胀，气孔开放。

一般情况下，植物根吸水量的99％左右都通过气孔以气态形式散发到体外。但当植物的吸水量大于蒸腾失水量，此时空气中湿度又较大时，如早晨或傍晚，植物将水以液态形式通过水孔排出体外。水孔是分布在植物的叶尖或叶齿表面的排水孔，属于分泌组织的一种。它也是由成对并列的保卫细胞围成，但不能调节关闭，始终开放着。水孔内方有排列疏松的薄壁细胞，这些细胞的间隙与管胞的末端相通连。水从管胞流出，通过薄壁组织间隙而经水孔流出。这样看来，气孔与水孔在构成、分布、性质等方面存在着一些微小差异，但最终都是使体内的水分进入到外界环境之中。