航海系的主要任务是培养出具有航海专业技术的远洋高级船员，现已拥有一个职称、学历、资历、年龄结构较合理的专业教学团队。专业教师都来自我国各大航海类院校，并拥有较丰富的远洋航行实践经验。

航海系已有占地2600平方米的省市共建轮机技能训练中心、轮机和航海综合实验室等，其中的实验设备也通过政府融资平台、政府财政资助等多途径购置，实验场地及设备基本能满足正常的教学需要。

为了提高人才培养质量，适应现代航运事业发展的要求，航海系对航海类专业学生实行半军事化管理。从2009年9月实施以来，学生的综合素质得到了大幅提升。同时航海系还实行学生素质综合测评制度，通过得分绩点的方式对学生的德、智、体、美、劳全方面进行考评，极大地促进学生广泛地参与专业技能活动、拓展自身能力、提高个人综合素质的积极性。