西南石油大学南充校区配置了四个主要的教学单位：工程学院、信息学院、财经学院和基础教学部。

工程学院下设多个专业，包括焊接技术与工程、机械电子工程、城乡规划、工程造价、能源与环境系统工程、材料化学。

信息学院则开设有光电信息科学与工程、电子与计算机工程、信息管理与信息系统、数字媒体技术、电气工程与智能控制、网络工程、电子信息工程、电子信息科学与技术等专业。

财经学院包括财务管理、酒店管理、公共事业管理三个专业。

基础教学部作为西南石油大学在南充校区的教育单位，负责数学类、外语类、政治类、体育类、军事类等学科的教学与研究工作。部门内设有马克思主义教研室、大学外语教研室、大学数学教研室、大学体育教研室，拥有教职工30多人，其中副教授及以上职称的教师占了专职教师的40%。