齐齐哈尔的大学有齐齐哈尔大学、齐齐哈尔医学院、齐齐哈尔工程学院、齐齐哈尔高等师范专科学校和齐齐哈尔理工职业学院。其中，齐齐哈尔大学是黑龙江省西部地区唯一一所省属综合性普通高等学校，成立于1952年，由原齐齐哈尔轻工学院和原齐齐哈尔师范学院合并组建。学校致力于培养高素质综合性人才，是黑龙江省高水平大学和重点建设高校。

齐齐哈尔医学院创建于1946年，最初名为“黑龙江军区军医学校”。历经数次更名，1986年升格为“齐齐哈尔医学院”。作为黑龙江省特色应用型本科高校，齐齐哈尔医学院是首批“卓越医生教育培养计划”试点高校，致力于培养高素质医疗人才。

齐齐哈尔工程学院则是一所全日制民办普通本科院校，前身是齐齐哈尔第一机床厂重型机床制造学院，创建于1958年。学校注重培养学生的实践能力和创新精神，为社会输送了大量的工程技术人才。

齐齐哈尔高等师范专科学校则是一所历史悠久、文化底蕴深厚的学校，始建于1906年。学校秉承“敦品砺学、修身强技、求精务实、为人师表”的校训，立德树人、立教报国，为社会培养了大量优秀教师。

齐齐哈尔理工职业学院成立于1981年，前身是齐齐哈尔市职工建筑工程学院。学院环境优美，被誉为“园林式”单位。学院在2019年获得了第二届黑龙江省高校系统“文明校园”荣誉称号，致力于为社会培养高素质的技术人才。