大连理工大学自动化专业好。

1、排名上。根据查询软科中国排行榜显示，大连理工大学自动化专业在全国高校中为第19名，中南大学为第23名。

2、学校特色上，大连理工大学为理工类院校，学校的电气工程及其自动化是国家特色专业，中南大学属于综合类院校，特色专业侧重于临床医学等方面。