内蒙古农业大学的普通本科学费是3500元/年~6000元/年；高职本、专科学费是4500元/年~5000元/年；蒙语授课学费是相应的汉语授课专业学费的80%；民族预科班学费是第一年按蒙语授课专业学费收取，第二年进入汉语授课班按汉语授课相应专业学费收取；艺术设计专业学费是6000元/年；中加联合办学学费是18000元/人年。

内蒙古农业大学设有动物科学学院、生态环境学院、机电工程学院、水利与土木建筑工程学院、材料科学与艺术设计学院、经济管理学院、食品科学与工程学院、计算机与信息工程学院、国际教育学院、继续教育学院（中央农业干部教育培训中心农大分院）、职业技术学院、体育教学部等22个院（部），其中内蒙古农业大学职业技术学院是全国高等职业教育示范院校建设单位。