国网电科院（国网电力科学研究院）与中国电科院（中国电力科学研究院）在多个方面有着显著的差异。

首先，在地理位置上，国网电科院总部位于江苏省南京市，同时在武汉设有院区，并在北京、上海、深圳等地建立了科研和产业基地。而中国电科院则位于北京海淀区，是国家电网公司直属的科研机构。

其次，在研究领域和重点上，国网电科院专注于电力自动化及保护、电力信息通信、电力电子、发电及水利自动化设备、轨道交通及工业自动化设备等方面的研发、设计、制造、销售、工程服务与总承包业务。中国电科院则着重于超/特高压交直流输变电技术、电网规划分析及安全控制技术、输变电工程设计与施工技术、配用电技术以及新能源、新材料、电力电子、信息与通信、能效测评及节能等技术的研究。

此外，在组织结构上，国网电科院拥有17个研究所、8个产业分公司，并创建了9个子公司。中国电科院则设立了多个管理部门和业务部门，以及国家级和院级实验室。

综上所述，国网电科院和中国电科院在地理位置、研究领域和重点、组织结构等方面均存在明显的区别。两者共同为中国的电力科学技术发展和国家电网的稳定运行做出贡献。