交大复旦在各自领域都比对方好，具体看你偏向哪方面。生物学和医药领域交大全国前三，这是复旦没法比的。而化学领域复旦全国前五，也是交大及不上的。就业前景来看，制药比化学更好一些。另外，复旦强的是化学本身，和化工是两码事，化工方面还不如去更好的华东理工呢。