对比了一下两校官方的信息：

西南大学设置有二级学院音乐学院，能将音乐相关学科单独设置为二级学院证明西南大学是比较重视音乐相关专业的发展的，而且西南大学的音乐系底蕴比较深厚，师资力量也比较雄厚。

四川大学的音乐系归属于艺术学院二级学院，另外从四川大学艺术学院的介绍来看，更偏重于音乐理论和文化的研究，不过四川大学作为西南地区最高学府而且是世界一流大学B类建设高校，学校层次上要高于西南大学。

综合比较来看，如果更看重学校的名气和声誉，就选择四川大学；如果更看重学科专业的实力，就选择西南大学。