潘懋元先生的教育口述史分为六个部分:

第一部：早年生活。潘先生出生在家乡，他的父母和哥哥在成长过程中对他影响深远。他插班进入小学，对文学的热爱奠定了早期的基础。初为人师，他选择了师范教育，成为乡村教师，后来投身于抗日战争的教育工作。

第二部：负笈求学。他在山间求学，两次挑战自我，考入厦大，实现了心愿。在南方的学术氛围和长汀精神的熏陶下，他的大学生活丰富多彩，经历江西的岁月。

第三部：厦大岁月。复建厦大附小，参与社会运动，新教育理念开始形成。研究生进修期间，他学习苏联教育，进行教学改革，研究杨贤江，并出版了《高等学校教育学讲义》。随后，他被借调到中央教科所，经历了干校劳动和云南的教育大讨论。

第四部：开创中国高等教育学。他创立了第一个高等教育研究机构，筹备并推动中国高等教育学会和教育学研究会的成立。主编的《高等教育学》标志着他的学术成果，探讨了教育内外部关系、高等教育与商品经济、传统文化与教育等问题，倡导大学素质教育和教育思想的转变。

第五部：深入研究高等教育问题。他关注地方化、大众化、民办教育、高职教育和农村教育的议题，以及高等教育的分类定位和学制改革。

第六部：对未来的期待。潘先生抱有对未来的希望，致力于培养英才，他的拳拳之心始终围绕教育事业。在后记中，他留下了对明天的殷切期盼。