工程管理硕士(Master of Engineering Management，简称MEM)是一种专业学位，于2010年由中国工程院提议，并由清华大学进行学科论证，同年获得批准设置。它专注于工程实践中的决策、计划、组织、指挥、协调与控制，涵盖重大工程建设项目的技术经济论证和实施管理，复杂新产品、设备、装备的开发、制造、生产管理，技术创新、技术改造、转型、转轨、国际接轨的管理，以及产业、工程和科技的重大布局与发展战略的研究与管理。现代工程规模日益扩大，决策流程复杂，技术种类繁多，组织结构庞大，历时漫长，参与人员众多，这使得工程管理在现代工程中的地位愈发重要。

相比之下，工商管理硕士(MBA)则是一种培养能够胜任工商企业和经济管理部门高层管理工作需要的务实型、复合型和应用型高层次管理人才的专业硕士学位。MBA的培养目标与一般硕士研究生不同，后者侧重于培养具有扎实理论基础和较强的科研和教学能力的高层次科研型和教学型人才。MBA的招生对象通常为大学本科毕业、大专毕业生、具有三年以上工作实践经验的国家机关事业单位干部和工商企业管理人员及技术人员，而其他硕士研究生可以招收应届毕业生和在职人员。

MBA教育与一般硕士研究生的培养方式也存在差异。MBA教育本质上是一种职业训练，特别强调在掌握现代管理理论和方法的基础上，通过商业案例分析、实战观摩、分析与决策技能训练等培养学生的实际操作技能，使学生具备更强的职业竞争力。而其他研究生则侧重于理论学习和学术研究。

因此，报考哪一个取决于你的职业规划和未来发展方向。如果你希望在未来成为企业管理的高层管理者，MBA可能是一个更好的选择。如果你更倾向于从事工程管理，特别是希望在复杂工程项目的决策、计划、组织和管理方面有所作为，那么MEM可能更适合你。