空军航空大学现有军事学、工学两大学科群。，设有航空飞行与指挥、飞机与发动机等16个专业。

截至2014年9月，学校拥有军事训练学、航空宇航科学与技术、控制科学与工程3个学术学位硕士授权一级学科，军事指挥、军队政治工作、军事装备3个军事硕士专业学位授权领域。2个工学学科为吉林省优势特色重点建设学科。

同时学校还承办了空军飞行人才培养专题研讨会、飞行安全发展建设论坛等学术交流活动，定期举办飞行学员开学典礼暨航空开放日活动。

2019年学校招收航空飞行与指挥和侦察情报学两个专业。