西南石油大学的南充校区与本部（成都校区）在多个方面存在差异。首先，办学层次方面，南充校区目前仅保留了高职专科的教育层次，而本部则涵盖了本科、硕士乃至博士多个教育层次。

其次，在学科专业设置方面，南充校区的学科专业种类相对较少，目前仅设有18个本科专业及1个硕士专业，相比之下，本部的学科专业设置更加丰富多样。

师资力量方面，本部拥有一支更为强大的教师团队，其中包括更多的高水平教师和研究生导师，而南充校区的师资力量则相对较弱。

在校园规模方面，南充校区占地面积约为700余亩，规模相对较小，而本部则拥有更大的校园空间。

地理位置上，南充校区位于四川省南充市，而本部则位于四川省成都市。值得注意的是，尽管南充校区和本部在办学层次、学科专业、师资力量及校园规模等方面存在差异，但两校区在教育教学、科研等方面仍保持着相互补充和协同发展的关系。

尽管两个校区在某些方面存在差异，但它们之间保持着紧密的联系与合作，共同推动西南石油大学的发展。