制药工程专业涵盖了一系列的基础课程和专业课程，为学生打下坚实的知识基础，同时培养他们解决实际问题的能力。有机化学、生物化学和微生物学是基础中的基础，这些课程为学生理解药物合成、生物分子作用以及微生物发酵提供必要的知识。化工原理则是制药工程的核心，它教授学生关于过程设计、设备选择、流体流动、传热、传质等理论和实践知识。

药物化学与天然药物化学则专注于药物的设计和开发，前者关注合成药物的结构与活性关系，后者则侧重于从植物、动物和微生物中提取有效成分。制药分离工程和制药工艺学是将化学药物或天然产物转化为药物成品的关键课程，前者教会学生如何通过各种分离技术提高产物纯度，后者则指导学生如何在制药过程中实现高效、经济、环保的操作。

制药设备及车间工艺设计课程让学生了解制药设备的设计原理和实际应用，以及车间工艺流程的优化。药品生产质量管理工程则强调质量控制的重要性，教会学生如何确保药品生产过程中的质量稳定性和安全性。药剂学、药物分析和药理学与毒理学分别从药物剂型设计、药物质量检验和药物作用机制三个方面，为学生提供了全面的药物知识。

这些课程不仅帮助学生掌握制药工程的理论知识，还通过实验和项目实践，培养学生的动手能力和创新思维，使他们能够在未来的工作中应对各种挑战。制药工程专业学生在学习过程中，会接触到各种先进的实验设备和技术，这不仅提高了他们的专业技能，也为他们未来的职业发展打下了坚实的基础。