复旦和上海交大的计算机研究生考试难度相当。在计算机学科的实力方面，两校都具有较强的实力。复旦的计算机软件与理论二级学科被列为国家重点学科，尤其在数据库方向表现突出。而上海交通大学的计算机一级学科同样为国家重点学科，整体发展较为均衡。

上海交通大学在计算机系统结构方面的实力强于复旦。相比之下，南京大学的整体实力要优于东南大学，但考试难度也相对较高。南京大学的计算机软件与理论学科更为突出，尤其在数据库方向具有明显优势。东南大学在计算机应用领域，尤其是网络方向，表现优异。

综合来看，复旦和上海交大在计算机学科方面各有特色和优势。复旦在数据库方向尤为突出，而上海交大则在系统结构方面更胜一筹。南京大学和东南大学虽然整体实力较强，但在具体研究方向上各有侧重，且考试难度相对较高。

选择哪个学校，还需根据个人兴趣和职业规划来决定。如果对数据库技术感兴趣，复旦是一个不错的选择；如果对系统结构有浓厚兴趣，上海交大则更适合你。而对于想要在计算机应用领域，尤其是网络方向有所发展的同学，东南大学可能是一个更好的选择。

总体来说，复旦和上海交大在计算机研究生教育方面都有较高的水平，选择哪个学校要根据个人兴趣和职业规划来做出决定。