济阳县国家税务局设有七个行政科室，均为正股级单位，分别承担不同的职能：

办公室主要负责制定年度工作计划和长远规划，处理日常政务，起草审核文件，组织综合性会议，以及税务科研、学术交流等工作。此外，还负责机关财务管理和目标管理考核，以及综合行政管理系统的实施。

计划统计科负责税收计划管理、会计统计、信息数据分析，处理纳税申报和税款入库，调查税源，进行税收分析，监控重点税源，并管理税收票证。

征收管理科负责税收征管法律的执行，制定征管制度，监控征管质量，推广税控器具，管理税务资料，以及纳税评估和日常管理性检查等工作。

政策法规科负责税收法规的日常监督，审理重大税收案件，处理税务行政诉讼和行政复议，确保法律执行的合规性。

税政管理科负责流转税、所得税等税种的管理，增值税稽核，税收协定执行，以及发票管理，包括发票领购、发售、检查等。

人事教育科负责干部任免、人事管理、教育培训，以及离退休人员的管理和服务，同时指导系统党建和工会工作。

监察室负责对税收法律、法规执行的监督，行政监察，廉政建设，以及涉及违法违纪案件的查处。

这些科室共同协作，确保税务局的高效运行和税收政策的严格执行。