电子税务局期末留底在账套上查看方法：

1、查询增值税纳税申报表，查看是否“期末留抵税额”有无数据。

2、导出财务账套，检查应交税费相关明细账。留抵增值税不是增值税科目“待抵扣进项税额”，留抵税额是指可抵扣的进项税大于销项税的差额，“待抵扣进项税额”是指已认证要以后期间才能抵扣的进项税。

3、获取财务审计报告，执行企业会计准则的企业，留抵税额在资产负债表中的“别的流动资产”或“别的非流动资产”项目列示。