南京三中和南航附中都是南京市内颇有名气的高中，各有特点，具体哪个更好则需要根据个人需求及喜好来评判。南京三中以教育质量见长，师资力量雄厚，学校环境优美，注重学生全面发展，提供多样化的社团活动和课外兴趣小组，为学生提供更广阔的发展空间。南航附中则与南京航空航天大学有密切合作，对于有志于航空航天领域发展的学生来说，这里的资源与优势更为突出。学校注重科技教育，设有与航空、航天相关的特色课程，与大学的科研机构紧密合作，为学生提供更多的实践机会与学术指导。选择哪个学校，需综合考虑自身兴趣、职业规划及学校特点进行决策。