我是上海光机所的，上海光机所的光学偏重于激光，是强场光学，另外有很大一部分是做激光器、材料、薄膜和光通讯的，说实话好像纯光学并不是太多，因为毕竟是研究所，偏向于激光应用；中科大的我不太了解，不过他们学校基础学科一项很好，应该不会差得。看你的兴趣了，如果喜欢激光或者激光器，光机所还不错；如果喜欢成像光学或者其他的，那可能这就不是你的首选。顺便提一句，虽然上光所待遇在中科院里不怎么行，但研究所的待遇毕竟要比大学好很多，这点也需要考虑一下。