工程款应该使用的科目是工程结算科目。

详细解释如下：

在工程款的处理上，通常使用“工程结算”科目进行核算。这是一个专门用于记录工程建设过程中，企业与客户或供应商之间的结算情况的科目。当企业收到或者支付工程款时，应该通过这一科目进行记录。这样可以清晰地反映工程款的收支情况，有助于企业的财务管理和成本控制。

“工程结算”科目主要涉及到以下几个方面：

1. 收入的记录：当企业收到工程款时，会计应将此款项记入“工程结算”科目的收入方，以反映该笔款项的性质和来源。

2. 支出的处理：当企业支付工程款时，会计应将款项记入“工程结算”科目的支出方，确保资金流向的透明和准确。

3. 成本的核算：与工程款相关的成本，如材料费、人工费等，也可以纳入“工程结算”科目进行核算，以便于成本的统计和分析。

使用“工程结算”科目能够直观地展示工程款项的流动情况，帮助企业和相关责任人进行决策和风险管理。同时，也有助于企业满足财务法规和税务部门的要求，确保财务操作的合规性。因此，在企业的财务管理中，正确运用“工程结算”科目是非常重要的。