羊水与胎粪吸入综合征，源于胎儿在母体内时的突发情况。当胎儿遭遇缺氧，会引发一种称为群体反射的生理反应，导致胎粪排出并诱发真正的呼吸。在这个过程中，胎儿可能将含有角化细胞的胎粪羊水一同吸入。胎粪的稠度至关重要，大量吸入会导致气管完全阻塞，引发肺不张和急性窒息缺氧，严重威胁生命。

相对而言，吸入的胎粪羊水较为稀薄或者量较少时，可能会造成部分阻塞，进而引发亚节段性肺不张和阻塞性肺气肿。更进一步，如果肺泡破裂，可能形成间质气肿或引发气胸。气体扩散至纵隔时，还会引起纵隔气肿，增加呼吸道压力。

胎粪羊水对呼吸道的刺激，加上可能发生的继发感染，会进一步恶化为肺炎，威胁新生儿的呼吸系统健康。进入康复期后，如果吸入物未能完全清除，可能会导致肺部炎症长期存在，形成纤维化，甚至导致肺气肿等慢性病变，影响婴儿的肺功能和生活质量。