预缴税款计入的科目是应交税费。

详细解释如下：

一、预缴税款的概念

预缴税款是指企业根据税务部门的规定，预先缴纳的部分税款。这是企业为了履行其纳税义务，提前支付的一部分金额。

二、会计科目的选择

在企业的会计记录中，为了清晰地反映税款的缴纳情况，预缴的税款应当被计入“应交税费”科目。这一科目主要用来核算企业应缴纳的各种税费，包括增值税、所得税等。

三、“应交税费”科目的作用

1. 记录真实性：通过“应交税费”科目，企业能够准确记录预缴的税款，确保财务数据的真实性和准确性。

2. 管理便利性：该科目有助于企业更好地管理现金流，以及对未来的税收支出进行预测和规划。

3. 税务合规性：正确使用“应交税费”科目有助于企业遵守税务法规，避免因账务处理不当而引发的税务风险。

四、实际操作注意事项

企业在处理预缴税款时，应确保相关凭证的完整性和准确性，并严格按照税法及会计准则的要求进行会计处理。此外，企业还应密切关注税务政策的变动，以确保税务处理与法规保持一致。

总之，预缴税款应计入“应交税费”科目，企业在进行会计处理时需严格遵守相关法规，确保财务处理的准确性和合规性。