省级人民政府燃气管理部门。

甘肃燃气经营企业从业人员专业培训考核合格证书是由省级人民政府燃气管理部门发放的。所以专业培训考核合格证书需要在省级人民政府燃气管理部门报考。

根据《燃气经营企业从业人员专业培训考核管理办法》甘肃燃气经营企业从业人员专业培训考核合格证书需要在省级人民政府燃气管理部门在接到专业考核申请后，应从燃气从业人员专业考核题库内抽取相应类别的专业考核题目，对不同类别燃气从业人员，分别进行专业考核。经专业考核合格的人员，由省级人民政府燃气管理部门发放相应类别的燃气从业人员专业培训考核合格证书。