亚洲（澳门）国际公开大学的在职MBA在中国大陆是否承认，这个问题需要从多个角度分析。

首先，从学历认证的角度，中国教育部对国外学历的认证有一定的规定和流程。一般来说，如果国外大学获得中国教育部的认可，其学历才可能被中国大陆承认。澳门国际公开大学是否获得中国教育部的认可，是决定其学历是否被中国大陆承认的关键因素。

其次，从合作意向的角度来看，你提到你所在的学校与澳门国际公开大学有过MBA合作意向。这意味着两校之间存在一定的教育合作和交流。虽然合作没有最终实现，但这并不意味着学历无法被承认。实际上，即使合作没有完全实现，如果澳门国际公开大学的MBA课程内容、教学质量和师资等方面达到中国大陆认可的标准，其学历也有可能被承认。

再者，从政策和实践的角度，近年来，中国教育部对于海外学历认证和承认的政策有所放宽，鼓励和支持中外教育合作与交流。这为海外大学的学历在中国大陆的承认提供了更多的可能性。

综合以上分析，虽然你提到的合作意向没有实现，但这并不代表澳门国际公开大学的MBA学历在中国大陆无法被承认。关键在于澳门国际公开大学是否获得中国教育部的认可，以及其课程、教学质量是否达到中国大陆的教育标准。在实际操作中，你可以通过查阅中国教育部的相关公告、咨询相关教育机构或直接联系澳门国际公开大学，了解其学历认证的具体情况，以便做出更准确的判断。