智能医学工程考研院校在选择时，需要综合考虑多方面因素。明确答案如下：

智能医学工程考研的优选院校包括但不限于北京大学、复旦大学、上海交通大学等。

智能医学工程作为新兴的交叉学科，融合了医学、工程学、计算机科学等多个领域。因此，在选择考研院校时，应关注学校在这些领域的综合实力。北京大学凭借其强大的医学部背景以及工学院的技术支持，在智能医学工程领域具有显著优势。复旦大学和上海交通大学同样拥有顶尖的医学院和工程学院，为智能医学工程的研究与实践提供了坚实基础。

除了上述院校，还有不少高校在智能医学工程方面表现出色。例如，浙江大学、华中科技大学等，这些学校在医学与工程学的交叉研究上有着深厚的积累，能够为考生提供优质的学术环境和研究资源。在选择院校时，考生还可以结合自己的兴趣和职业规划，选择那些在特定领域如医学影像处理、医疗大数据分析等方向有突出研究成果的院校。

总之，智能医学工程考研院校的选择应综合考虑学校的学科实力、研究资源以及个人发展规划。不同的院校有着不同的研究侧重点和教育资源，考生应根据自身情况灵活选择，以找到最适合自己的学术成长之路。

在做出决定之前，建议考生深入了解各院校的师资力量、实验设施、就业情况等方面的信息，必要时可亲自参观校园，与在校学生或导师交流，以便更直观地感受学校氛围，做出明智的选择。