自考毕业证上会盖几种特定的章，具体包括：

首先是学校盖章。对于自考本科毕业生而言，需要前往所在学校的学籍办公室或教务处进行毕业手续的办理，领取毕业证书和学位证书。学校会在这些证书上盖章，用以确认学生的身份和完成学业的情况。

其次是教育部学历证书电子注册备案章。自考本科毕业生的学历证书需要进行电子注册备案，这一步骤在领取学历证书时就需要完成。教育部会在学历证书上盖章，以确保学历信息的真实性和准确性。

对于已获得学位的自考本科毕业生而言，学位证书也需要办理电子注册备案。此时，教育部会在学位证书上盖上学位证书电子注册备案章，以确认学位信息。

最后，自考本科毕业生的学历证书还需到所在省份的教育行政部门进行备案。教育行政部门会在学历证书上盖上省级教育行政部门学历证书备案章，确保学生在本省的教育系统中的信息准确无误。