深圳中学高中高一高二不设重点班，只设超常班。

在开学之前（军训之前），深圳中学会举行一次分班考试。根据成绩，那些特别优秀的学生就会被分入超常班（即七单元），其余的学生就随机分配各六个单元。

深圳中学的单元制度是一个课改的创新制度。共分为七个单元，其中1~6单元为普通单元，每个单元三个班，总人数大约在130人左右。进行大型活动都以单元为模块进行，比如足球赛就是单元队的模式进行。有一些课也是整个单元一起上，比如体育课等。这就是深圳中学的一种融入学校的模式教育。7单元就是超常班的单元，一般有两个班，100人左右。

到了高三，经过高二下学期末的分班考试，就会在各科分出重点班。