上海交通大学拥有众多系别，其中包括物理系，致力于物理学基础理论与应用研究。生物医学工程系则专注于生物医学技术与工程，结合生物学、医学和工程学，推动医疗科技的发展。机械与动力工程系研究机械设计、制造及其自动化技术，以及动力设备的设计、制造和运行技术。信息安全工程系专注于信息安全技术的研究与应用，旨在保护信息系统的安全。微电子系则集中于微电子技术，包括半导体器件、集成电路设计与制造等。材料与工程系则关注材料科学与工程，涉及材料的合成、加工、性能及应用。

理学院下设数学系，专注于数学理论与应用研究，培养学生的数学思维与解决实际问题的能力。化学系则研究化学基本理论、方法及其应用，推动化学科学的发展。安泰工程与管理系则专注于工程与管理的交叉领域，结合工程技术与管理理论，培养具备工程管理能力的人才。此外，上海交通大学还有其他系别，如电子信息与电气工程系，研究电子与电气工程领域的技术与应用；电子信息科学与技术系，专注于电子信息科学与技术的研究与应用；电子信息工程系，研究电子信息工程领域的技术与应用；以及电子信息与通信工程系，专注于电子信息与通信工程的研究与应用。

这些系别不仅涵盖了广泛的学科领域，还注重学科交叉与融合，为学生提供了丰富的学术资源和实践机会。此外，上海交通大学还设有其他系别，如船舶与海洋工程系，研究船舶与海洋工程领域的技术与应用；电子信息与电气工程系，研究电子与电气工程领域的技术与应用；电子信息科学与技术系，专注于电子信息科学与技术的研究与应用；电子信息工程系，研究电子信息工程领域的技术与应用；以及电子信息与通信工程系，专注于电子信息与通信工程的研究与应用。