在进行会计处理时，如果已经进行了未开票的申报并且相关款项已经入账，那么在后续开具发票时，需要调整原有的会计分录。具体操作可以分为两个步骤。首先，需要冲销原有的分录，会计分录为：借：应收账款或现金或银行存款，贷：主营业务收入，应交税金-销项税额。这一步骤是为了恢复账面的原始状态。

其次，根据实际开具的发票内容，重新做分录，会计分录为：借：应收账款或现金或银行存款，贷：主营业务收入，应交税金-销项税额。这样，账面记录就与实际的经济业务保持了一致。

需要注意的是，在进行会计处理时，一定要严格按照会计准则和税法的相关规定操作，确保会计信息的真实性和准确性。同时，确保所有操作符合企业内部控制的要求，避免出现任何财务风险。

在实际操作中，建议企业在开具发票后，及时更新账目，确保账实相符。如果在处理过程中遇到任何问题，可以咨询专业的会计师或税务顾问，以确保所有操作的合法性与合规性。