自考本科和函授本科均属于非全日制学历，为第二学历，含金量较高。主要区别体现在报考条件不同、报考时间不同、考试方式不同、学习方式不同、学制不同、毕业形式不同。

报考条件方面，函授专升本要求考生具有高中或专科及以上学历，而自考专升本则没有前置学历要求，但毕业时需要出具专科或以上学历证书。

在报考时间上，函授专升本一般在8-9月完成网上志愿填报及报名，9月确认，10月末参加全国统一的入学资格考试。自考本科考试则在每年4月和10月，报名时间通常在考试前的一个月左右。

考试方式上，函授专升本需要参加全国统一考试，而自考专升本则不设入学考试，采用学分制，考生通过考一门获得一门证书，全部通过后申请毕业。

学习方式方面，函授专升本以自学为主，辅以集中面授，自考专升本则完全自主学习。

学制上，函授专升本学制通常为2.5-3年，而自考专升本并无学制要求。

毕业形式上，函授专升本毕业生可获得成人教育毕业证书，也可申请学历证书。自考专升本则需要完成专业规定的课程后，才能申请学历证书。

函授和自考的毕业证书文凭均属于非全日制本科学历，属于国民教育体系，受国家承认，并可在学信网上查询。它们的毕业证含金量较高，享有与普通高校同等学历层次的待遇，对晋升、留学、考编、考研等有积极作用。

自考专升本毕业难度略高于函授专升本，自考宽进严出，虽然入学门槛较低，但考试科目较多，可能对在职人员复习造成一定压力。而函授专升本则严进宽出，入学后仅需完成期末考试合格即可。考生应根据自身情况选择合适的考试方式。