一、如果你单位是事业单位，即国有单位，根据情况做：

（1）如果是专项工程：

借：银行存款 400万

贷：拨入专款 400万

（2）如果非指定专项工程：

借：银行存款 400万

贷：财政补助收入 400万

二、如果你单位是民间非营利组织，可做：

借：银行存款 400万

贷：政府补助收入——限定性收入 400万

不过你们单位具体情况，包括性质等不很清楚，所以回答可能不具有针对性。