南京的考研机构有：

1. 南京新东方考研机构

2. 文都教育考研机构

3. 南京启航考研培训机构

南京新东方考研机构：新东方作为国内知名的教育培训品牌，在南京设有考研培训机构。该机构提供全方位的考研辅导，包括公共课和专业课，拥有经验丰富的教师团队和完备的教学设施。

文都教育考研机构：文都是一家专注于考研培训的教育机构，在南京设有分支机构。他们提供考研全程辅导，包括备考规划、系统课程、模拟考试等，旨在帮助考生全面提升，顺利考上理想的研究生院校。

南京启航考研培训机构：启航考研是南京地区一家专注于高端考研培训的机构。他们拥有一支经验丰富的教学团队和高效的学习模式，能够为考生提供针对性的指导和帮助。启航考研注重学生的学习效果，努力提升教学质量，为考生取得理想的考研成绩提供保障。