没影响的。只要后面报考的是剩下的那科就可以。考过的系统上是有记录的。

凡遵纪守法，具备工程类或工程经济类中等专科以上学历并从事建设工程项目施工管zhi理工作满2年的人员，可报名参加二级建造师执业资格考试。

已取得《二级建造师执业资格证书》的人员，可根据实际工作需要，选择《专业工程管理与实务》科目的相应专业，报名参加“二级建造师相应专业考试”，报考人员须提供资格证书等有关材料方能报考。

扩展资料：

考试大纲分“综合大纲”和“专业大纲”两部分。综合大纲包括《建设工程施工管理》、《建设工程法规及相关知识》2个科目。专业科目大纲《专业工程管理与实务》共分建筑、公路、水利水电、机电、矿业、市政公用6个专业。

本大纲适应我国经济形势发展要求，符合实际，突出重点，对二级建造师知识结构提出掌握、熟悉和了解三个层次的要求。本大纲既是考试命题的指导性文件，也是建设工程施工管理关键岗位专业技术人员复习备考的依据。

参考资料来源：百度百科-二级建造师执业资格考试