厦门大学校长的行政级别是副部级，这与我国31所被国家确定为副部级的高校的党委书记和校长相当。这些高校包括了北京的清华大学、北京大学等7所，天津的南开大学、天津大学等，以及东北、西北、上海、江苏、湖北、湖南、安徽、福建、广东、浙江、四川、重庆、山东、甘肃等地的顶级学府。除这31所副部级高校外，大部分普通本科院校通常为正厅级，相当于地级市的书记、市长级别。大学校长的级别反映了学校的行政地位和国家的重视程度，厦门大学作为其中一员，体现了其在国家高等教育体系中的重要角色。值得注意的是，国防科技大学虽属于副大军区级，但因其特殊性质也被列为副部级。这32所高校都是国家985工程的重点建设大学，进一步突显了它们在教育领域的卓越地位。