在江苏地区，选择通信工程专业的研究生院校时，可以考虑南京航空航天大学、南京理工大学、东南大学和南京邮电大学。这些学校在通信工程领域有较强的学术实力和研究基础。

南京航空航天大学在航空航天和电子工程方面具有一定的优势，其通信工程专业也受益于此，具备较强的研发能力和实践教学条件。

南京理工大学在电子科学与技术领域有着深厚的底蕴，通信工程专业是其重点学科之一，拥有一支高水平的教学科研团队。

东南大学的电子科学与技术学科在全国享有较高声誉，通信工程专业是该校的优势学科，培养了众多优秀人才。

南京邮电大学则在通信领域有着突出表现，其通信工程专业在全国享有较高声誉，特别是在无线通信、移动通信和通信网络等方面有着显著的研究成果。

苏州大学虽然不是通信工程领域的强校，但在电子信息科学与技术方面也有一定的实力，可以作为备选之一。

综合来看，上述几所学校的通信工程专业各有特色，学生可以根据自己的兴趣和职业规划进行选择。

值得注意的是，除了学校的专业实力，学生还应关注学校的地理位置、师资力量、科研经费、就业率等多方面因素，以做出更合适的选择。