工程部计入会计科目应为“在建工程”科目。

详细解释如下：

在工程部的工作中，涉及到多个与工程项目相关的支出和成本，这些支出和成本在会计上需要准确记录和反映。为了对工程项目进行管理和跟踪，“在建工程”这一会计科目应运而生。当企业涉及建设新的工程或者对现有工程进行改造和扩建时，与之相关的各项费用性支出都会在“在建工程”这一科目中进行归集。这包括直接的建筑成本，如建筑材料费用、人工费用、设备购置费用等，也包括间接的相关费用，如设计费、监理费、工程管理费用等。随着工程的进展，这些费用会逐步发生并计入会计记录中。当工程完工并验收合格后，会计上会将“在建工程”科目中的余额转入相应的固定资产科目，从而反映企业资产的变化。通过这样的会计处理，企业能够清晰地了解每个工程项目的投资情况、成本结构以及盈利状况，为决策提供有力支持。

因此，在工程部的工作中涉及的会计内容主要是关于“在建工程”科目的管理和记录。这不仅包括日常的账务处理，还需要定期进行成本核算和报告，以确保工程相关的财务数据准确、完整。同时，“在建工程”科目的合理设置和运用也是企业规范工程管理、优化资源配置的重要手段之一。