厦门大学拥有两个主要校区，分别是位于厦门市思明南路422号的思明校区，以及位于厦门市翔安区新店镇的翔安校区。翔安校区作为新校区，主要用于接收生命科学学院、海洋与地球学院、环境与生态学院、医学院、药学院、公共卫生学院和能源学院的新生以及国际学院爱尔兰都柏林项目的学生。

而思明校区则接待除上述学院之外的其他学院的新生，包括人文学院、经济学院、管理学院、法学院、数学科学学院、物理科学与技术学院等。值得一提的是，虽然一些人认为漳州校区也是厦门大学的一部分，但实际上漳州校区现已成为独立学院嘉庚学院，实行二本招生，严格来说并不属于厦门大学。

思明校区是厦门大学的主体部分，它不仅拥有悠久的历史和深厚的文化底蕴，也是许多著名学者和优秀学生的聚集地。这里汇聚了厦门大学众多的学术资源和研究机构，如图书馆、实验室和各类研究中心，为学生提供了丰富的学术交流和实践机会。

相比之下，翔安校区则更加注重实验教学和科学研究，特别是在生命科学、海洋科学、环境科学等领域，拥有先进的科研设备和实验室，为学生提供了良好的科研环境。

两校区各自承担着不同的教育使命，共同构成了厦门大学完整的教育体系。思明校区以培养具有扎实理论基础和广阔视野的复合型人才为主，而翔安校区则侧重于培养具有较强实践能力和创新能力的专业人才。