大连海事大学东山校区涵盖广泛的专业领域，致力于培养专业人才。航海学院下设航海技术、海事管理、交通运输（国际航运管理）、救助与打捞工程、船舶电子电气工程、港口航道与海岸工程、海洋科学类（航海保障）、导航工程、交通运输类（航海保障）、救助工程、消防工程、物联网工程等专业。

轮机工程学院则包括轮机工程、船舶电子电气工程、交通运输类（港口电气工程）、能源与动力工程、物联网工程等方向。

信息科学技术学院开设计算机科学与技术（航海保障信息化）、软件工程、网络工程、物联网工程、电子信息工程、通信工程、电子信息科学与技术、微电子科学与工程、光电信息科学与工程、信息管理与信息系统、信息安全等课程。

管理学院提供旅游管理、会计学、经济学类（国际经济）、公共事业管理、行政管理、劳动与社会保障、物流管理等管理学专业。

物理系则集中于应用物理学的研究和教学。

外语系设有英语（航运物流）、日语（航运物流）、俄语（航运物流）等语言学习方向。

法学院提供法学教育，培养法律专业人才。

环境科学与工程学院则涵盖环境工程、环境科学、资源循环科学与工程等环境科学领域。

数学系则集中于数学与应用数学的学术研究。

体育部则提供社会体育指导与管理的专业教育。

东山校区还设有继续教育学院和航海训练与研究中心，为在校学生提供更全面的学习资源和实践机会。