西安交通大学能动学院的环境工程专业侧重于能源化工领域的研究，包括污水处理和煤燃烧处理等课题。相比之下，人居环境建筑学院的环境工程专业则更注重与建筑相关的环境问题，例如管道布局、给排水系统以及空调系统的优化设计。这两者在培养目标和研究方向上存在明显差异。

能动学院的环境工程专业通常要求学生具备扎实的化工和能源领域的基础知识，课程设置可能包括化学工程原理、能源系统分析、环境监测与评价等。而人居环境建筑学院的环境工程专业则更侧重于建筑环境科学，课程可能涉及建筑物理、建筑节能、室内环境控制等。

在研究生录取分数线方面，由于两个学院的研究方向和培养目标不同，分数线也会有所区别。能动学院的环境工程专业可能会要求较高的化学和化工基础知识，因此分数线可能会相对较高。而人居环境建筑学院的环境工程专业则可能更注重学生的建筑学背景和环境科学知识，因此分数线可能会有所不同。

总体来说，两个学院的环境工程专业各有侧重，考生可以根据自己的兴趣和职业规划选择适合自己的专业。能动学院适合对能源化工领域感兴趣的学生，而人居环境建筑学院则更适合对建筑环境科学有兴趣的学生。

此外，具体录取分数线会受到多种因素的影响，如当年考生的整体水平、招生计划等，因此无法给出一个固定的标准。建议考生在选择专业时，不仅要考虑分数线，还要结合自身的兴趣和职业规划，以及对课程设置的了解。

值得注意的是，两个学院的环境工程专业都属于环境工程领域，但侧重点有所不同，因此在学习过程中可能会遇到不同的挑战和机遇。选择哪个学院的环境工程专业，需要根据个人兴趣和职业发展方向来决定。

在实际应用中，两个学院的环境工程专业也会有很多交叉点，比如在处理建筑废弃物的资源化利用、建筑能耗的优化等方面，都需要综合运用环境工程和能源化工的知识。因此，即使选择了其中一个专业，也可以有机会接触和学习到另一个专业的知识和技能。