吉安市内有多所高中教育机构，分布在不同的区县。在吉州区，有白鹭洲中学、吉安市第一中学、吉安三中和吉安四中，以及吉安十二中和吉阳高级中学。青原区则设有青原区井冈山师院附中、吉安影视艺术学校以及吉安市值夏高级中学。吉安县内有吉安县立中学和吉安县第二中学。吉水县则以江西省吉水中学和吉水县第二中学为著名。峡江县有峡江中学和峡江二中，以及文达中学。永丰县的江西省永丰中学、永丰藤田中学和欧阳修中学，以及永丰三中和永丰二中，是该区域内的重点高中。新干县则有江西省新干中学和新干实验中学，新干朝阳学校也颇有名气。泰和县的江西省泰和中学和泰和二中，以及泰和三中、六合中学、三都中学、沙村中学、山谷中学，提供优质的高中教育。遂川县的江西省遂川中学、遂川二中、瑶厦中学、三合中学、唐彩中学和于田中学，也深受学生和家长的信赖。万安县则有江西万安芙蓉万安中学、万安崇文中学、万安实验中学和万安第五中学，万安窑头中学、沙坪中学等。安福县则有安福中学、安福二中、安福三中、洲湖中学和严田中学。永新县内有任弼时中学、永新二中、禾川中学、永新兴华高中、育才中学和第三中学。井冈山市则有江西省井冈山中学和宁冈中学。