增值税专用发票可以开零税率。

前提条件是销售的货物是免税货物或属于零税率的才行，例如军用物资开增值税专用发票的时候，可以直接在开票界面内的税率栏选择0%；而日常开票的时候如果选择销售正常货物默认会选择的是17%。

增值税一般纳税人接受交通运输业服务抵扣进项税额存在以下三种情况：

1、接受一般纳税人提供的货物运输服务，取得其开具的货物运输业增值税专用发票，按照该发票上注明的增值税额，从销项税额中抵扣；

2、接受小规模纳税人提供的货物运输服务，取得其委托税务机关代开的货物运输业增值税专用发票，按照该发票上注明的增值税额，从销项税额中抵扣。如未取得代开的专用发票或取得的代开专用发票不符合规定，则不得计算抵扣进项税额；

3、接受铁路运输服务，取得其开具的运输费用结算单据，按照该运输费用结算单据上注明的运输费用金额和7%的扣除率计算的进项税额，从销项税额中抵扣。

增值税专用发票，既是增值税制度的基本内容之一，也是增值税得以实施的一项重要基础工作。其对增值税的计算和管理起着决定性的作用。

增值税专用发票的重要意义表现在以下两个方面：

1、增值税专用发票，不仅具有商事凭证的作用，由于实行凭发票购进税款扣税，购货方要向销货方支付增值税，还具有完税凭证的作用，是兼具销货方纳税义务和购货方进项税额的合法证明；

2、增值税专用发票可以将一种货物从最初生产到最终消费之间的各个环节联接起来，按专用发票上注明的税额，逐环节征税，逐环节扣税，把税款从一个经营环节传递到下一个经营环节，直到把商品或劳务供应给最终消费者。从而使各环节开具的专用发票上注明的应纳税款之和就是该商品或劳务的整体税负，体现了增值税普遍征收和公平税负的特征。

《中华人民共和国增值税暂行条例实施细则》第二十条 混合销售行为依照本细则第五条规定应当缴纳增值税的，该混合销售行为所涉及的非增值税应税劳务所用购进货物的进项税额，符合条例第八条规定的，准予从销项税额中抵扣。