哈尔滨工程大学学硕与专硕在多个方面存在差异。首先，从录取分数线来看，相同专业的专硕通常要求的分数较低，而学硕则要求较高，这使得专硕相对容易考取，学硕则更具挑战性。

其次，学制也是两者的重要区别之一。专硕的学制为两年，而学硕则需要三年。这种差异不仅影响了学生的学习时间和毕业时间，还可能对课程设置和学术要求产生影响。

此外，专硕和学硕在继续深造的路径上也有所不同。专硕学生无法直接考博，而学硕则可以继续攻读博士学位。这为学硕学生提供了更多的学术发展机会，同时也意味着他们需要在硕士阶段积累更多的基础知识和研究经验。

这些差异反映了学硕和专硕在培养目标、教学内容和学术要求上的不同侧重点。学硕更注重学术研究能力的培养，而专硕则更侧重于实践技能和职业能力的提升。因此，学生在选择时应根据自己的兴趣和职业规划做出合理选择。